Project Origin jest kontynuacją wielokrotnie nagradzanej strzelaniny pierwszoosobowej First Encounter Assault Recon. Niedługo po wydarzeniach znanych z pierwszej części gry F.E.A.R., jednostka Special Forces, odbywająca rutynową misję w mieście Auburn, trafia w sam środek nadnaturalnej eksplozji. Alma, rządne zemsty przerażające dziecko władające potężnymi mocami, wyzwala swój gniew na miasto, pogrążając je w chaosie. Napięcie narasta, w trakcie gdy jednostka walczy z wrogimi potworami i nadprzyrodzonymi mocami, szukając sposobu na powstrzymanie Almy i dotarcie do tajemniczych mocy sprzymierzonych przeciw ludzkości. Jako Michael Becket, członek jednostki antyterrorystycznej Delta, będziesz musiał stawić czoła najbardziej przerażającej z mocy, zanim będzie za późno.